安全配置方面，馬自達CX-9與昂科雷都配備了包括主副駕正面雙氣囊、前排側氣囊和前后頭部氣簾在內的6氣囊；同時在主動安全配置上也都配備了車身穩定系統和防翻滾控制系統。

【CX-9配備了牽引力控制開關】

【昂科雷配備的ESP開關】

僅有的差別在于昂科雷標配了胎壓監測，另外昂科雷的低配精英版并沒有配備倒車影像。

在舒適性配置上二者的表現同樣非常接近，駕駛席座椅記憶、腰部支撐、第二排座椅移動、后排獨立空調等對提升駕乘舒適性有明顯效果的功能雙方都有配備。

【CX-9和昂科雷都配備了前排座椅電加熱（圖為CX-9）】

【CX-9和昂科雷都配備了后排獨立空調（圖為CX-9）】

CX-9的優勢在于提供了感應雨刷以及空調花粉過濾功能，同時外后視鏡電動折疊功能也是對手低配車型所不提供的。

【駕駛員座椅記憶在CX-9和昂科雷上都能找到（圖為昂科雷）】

【電動尾廂門CX-9和昂科雷都有配備（圖為CX-9）】

昂科雷則較對手多出了座椅通風（只有旗艦版車型提供），另外副駕也配備有腰部支撐功能；更為關鍵的是第二排座椅提供靠背角度調節，這一功能對于提升后排乘坐的舒適性來說顯得尤為關鍵。